Με την Ένωση της Επτανήσου το 1864 τα Κύθηρα υπήχθησαν διοικητικά στο νομό Ζακύνθου. Το Δεκέμβριο του 1865 η Επαρχία Κυθήρων διαιρέθηκε σε 3 Δήμους Βασ. τάξεως, το Δήμο Κυθηρίων με πληθυσμό 3.645, το Δήμο Ποταμίων με πληθυσμό 7.006 και το Δήμο Φρατσίων με πληθυσμό 3.339.
Σύνολο του πληθυσμού των Κυθήρων 14.990!